熊清

发布时间:2016-04-28 来源:本站原创 作者:本站编辑   浏览次数:



姓名:熊清 性别:
学历:博士 职称:副教授
部门:计算机科学系 电话:
邮件地址:qingx@swu.edu.cn
研究方向:生物信息学、统计遗传学、数据挖掘、Java应用系统开发
个人简介
2004年博士毕业于重庆大学生物医学工程专业生物信息学方向,2005年进入西南大学计算机科学与技术系从事教学科研工作,2009年-2011年在美国杜克大学(Duke University)、2011-2012年在北卡大学教堂山分校(The University of North Carolina at Chapel Hill)从事博士后研究,在此期间的主要研究方向为生物信息学、统计遗传学与Java应用系统开发。

现在的研究兴趣与研究项目主要集中在以下几个方面:
1、发展计算机/统计算法与软件整合多种组学数据(基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、表观基因组等)解析疾病或其它复杂性状的分子遗传机制;
2、发展计算机/统计算法与软件重建基因调控网络与调控网络与复杂性状的关联分析,解析复杂性状的网络调控模式;
3、高通量基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、表观基因组数据的信息挖掘,鉴别有生物学意义的信息模式;
4、Java应用系统设计与实现。
现有的科研合作单位主要包括家蚕基因组生物学国家重点实验室、北卡大学教堂山分校、杜克大学、西南大学心理学院与生命科学学院

近年科研代表作:
1, Xiong Q, Ancona N, Hauser ER, Mukherjee S, Furey TS. Integrating genetic and gene expression evidence into genome-wide association analysis of gene sets. Genome Research. 2012, 22(2) : 386-397
2, Xiong Q, Jiao Y, Hasty KA, Canale ST, Stuart JM, Beamer WG, Deng HW, Baylink D, Gu W. Quantitative trait loci, genes, and polymorphisms that regulate bone mineral density in mouse. Genomics. 2009, 93(5):401-414
3, Xiong Q, Qiu Y, Gu W. PGMapper: a web-based tool linking phenotype to genes. Bioinformatics. 2008, 24 (7):1011-1103

软件开发代表作:
1、GSAA – Gene Set Association Analysis
网址: http://gsaa.unc.edu/
2、PGMapper – Phenotype Genotype Mapper
网址: http://www.genediscovery.org/pgmapper/index.jsp
3、智能化学习辅导系统、智能化课程设计系统、研究性协作学习系统
网址: http://www.yuanlinedu.com/

招收具有计算机科学、信息科学、统计学、数学、生命科学、物理学或其它理工科背景的研究生。
教学情况
《Java程序设计》、《数据结构》、《数据库系统原理》等
科研情况
获奖情况
备注
关于兴趣:
1、我认为,对一切来说,只有热爱才是最好的教师,它远远超过责任感。——爱因斯坦
2、知之者不如好之者,好之者不如乐之者。——孔子
3、我之所以能在科学上成功,最重要的一点就是对科学的热爱,坚持长期探索。 ——达尔文
4、任何一种兴趣都包含着天性中有倾向性的呼声,也许还包含着一种处在原始状态中的天才的闪光。——张洁

关于创造性与独立思考能力:
1、提出一个问题往往比解决一个问题更重要。因为解决问题也许仅是一个数学上或实验上的技能而已,而提出新的问题,却需要有创造性的想像力,而且标志着科学的真正进步。——爱因斯坦
2、发展独立思考和独立判断的一般能力,应当始终放在首位,而不应当把获得专业知识放在首位。如果一个人掌握了他的学科的基础理论,并且学会了独立地思考和工作,他必定会找到他自己的道路,而且比起那种主要以获得细节知识为其培训内容的人来,他一定会更好地适应进步和变化。——爱因斯坦
3、如何辨别有希望的线索,是研究艺术的精华所在。具有独立思考能力,并能按其本身的价值而不是根据主宰当时的观念去判断佐证的科学家,最有可能认识某种确属新东西的潜在意义。——贝弗里奇

关于持之以恒:
1、作为一个科学家来说,我的成功……最主要是:爱科学-在长期思索任何问题上的无限耐心-在观察和收集事实上的勤勉-相当的发明能力与常识。——达尔文
2、不积跬步,无以至千里;不积小流,无以成江海。——荀子
3、我们应有恒心,尤其要有自信心!我们必须相信,我们的天赋是要用来做某种事情的。——居里夫人