王峻

发布时间:2016-04-28 来源:本站原创 作者:本站编辑   浏览次数:



姓名:王峻性别:
学历:博士 职称:副教授
部门:网络工程系电话:023-68254396
邮件地址:kingjun@swu.edu.cn

研究方向:机器学习、数据挖掘、生物信息学





个人简介

工学博士,副教授,研究生导师,CCF高级会员(人工智能与模式识别专业委员会通讯委员、生物信息学专业组委员),中国人工智能学会会员(生物信息学与人工生命专委会委员、机器学习专委会通讯委员),中国生物工程学会会员,ACM会员,西南大学机器学习与数据分析实验室成员。团队主页http://mlda.swu.edu.cn/

 

教育背景

2004年于哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院获得工学学士学位

2006年于哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院获得工学硕士学位

2010年于哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院人工智能与信息处理专业获得工学博士学位

2010年7月进入西南大学计算机与信息学院网络工程系从事科研教学工作。

2013.08-2014.08 美国罗切斯特大学 访问学者(Rochester University)

2015.01-2015.03 香港浸会大学 访问学者(Hong Kong Baptist University)

 

研究兴趣:机器学习(大规模数据特征选择,复杂数据聚类分析,基于深度学习的数据分析);数据挖掘(多源数据整合分析、多维数据网络构建与模式挖掘,大规模数据的并行分析);生物信息学(面向复杂疾病的生物特征识别,遗传交互作用识别,多组学数据遗传关联分析)

 

近年来,在国际知名刊物(Bioinformatics, BMC Bioinformatics, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, Neurocomputing, Applied Soft Computing, Soft Computing等),著名会议(SIAM Conference on Data Mining, International Joint Conference on Artificial Intelligence)等),国内一级学报(软件学报、计算机研究与发展、中国科学-信息科学、电子学报等)上发表科研论文40余篇,其中SCI收录25篇,一级学报收录8篇,EI收录6篇。

 

作为负责人主持完成国家自然科学基金青年基金,重庆市自然科学基金项目、教育部中央高校基本科研业务经费团队项目、重点项目和博士启动项目各1项。作为主要参与人完成科技部支撑计划2项,863国家级项目1项,国家自然科学基金项目7项,重庆市自然科学基金项目1项。受邀担任多个国际国内会议程序委员会委员、多个SCI期刊和国内学报的审稿人。

 


教学情况

主讲课程:

生物信息学, 研究生

数据库系统原理,本科生

交互式媒体原理(双语),本科生

计算机图形学算法,本科生

多媒体技术,本科生

人机界面学,本科生

局域网组网技术,本科生

西南大学含弘学院专业导师


科研情况

代表性论文(+第一作者或共同作者,*通讯作者):

1.     Yuying Xing+, Guoxian Yu*, Carlotta Domeniconi, Jun Wang, Zili Zhang. Multi-Label Co-Training, 27th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI), In Print. CCF A

2.     Qiaoyu Tan+, Guoxian Yu*, Carlotta Domeniconi, Jun Wang, Zili Zhang. Incomplete Multi-View Weak-Label Learning, 27th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI), In Print. CCF A

3.     Qiaoyu Tan+, Guoxian Yu*, Jun Wang, Zili Zhang, Carlotta Domeniconi. Multi-view Weak-label Learning based on Matrix Completion, SIAM Conference on Data Mining (SDM), In Print. CCF B

4.     Guangyuan Fu+, Jun Wang, Carlotta Domeniconi, Guoxian Yu*. Matrix factorization based data fusion for the prediction of lncRNA-disease associations, Bioinformatics. 2018, 34(9): 1529-1537. CCF B

5.     Guoxian Yu*, Guangyuan Fu, Jun Wang, Yingwen Zhao. NewGOA: predicting new GO annotations of proteins by bi-random walks on a hybrid graph, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, In Print. CCF C

6.     Long Zhang+, Guoxian Yu, Dawen Xia, Jun Wang*. Protein-Protein Interactions Prediction based on Ensemble Deep Neural Networks, Neurocomputing, In Print. CCF C

7.     Yingwen Zhao+, Guangyuan Fu+, Jun Wang, Maozu Guo, Guoxian Yu*. Gene function prediction based on Gene Ontology Hierarchy Preserving Hashing, Genomics, In Print.

8.     Xia Cao+, Jie Liu, Maozu Guo*, Jun Wang*. HiSSI: High-order SNP-SNP Interactions Detection based on Efficient Significant Pattern and Differential Evolution, 14th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA), In Print.

9.     路畅+,陈霞,王峻,余国先*,余志文. 基于稀疏语义的蛋白质噪声功能标注识别, 中国科学-信息科学, In Print.

10.  余国先*,傅广垣+王峻,郭茂祖. 基于降维的蛋白质不相关功能预测, 中国科学-信息科学, 2017, 47(10): 1349-1368.

11.  谭桥宇+,余国先,王峻*,郭茂祖. 基于标记与特征依赖最大化的弱标记集成分类, 软件学报, 2017,28(11): 2851-2864.

12.  余国先+,王可尧,傅广垣,王峻*,曾安. 基于多网络数据协同矩阵分解的蛋白质功能预测, 计算机研究与发展, 2017, 54(12): 2660-2673.

13.  Yanming Yu+, Jun Wang*, Qiaoyu Tan+, Lianyin Jia, Guoxian Yu. Semi-supervised Multi-label Dimensionality Reduction based on Dependence Maximization, IEEE ACCESS, 2017, 5: 21927-21940.

14.  Guoxian Yu, Yingwen Zhao+, Chang Lu+, Jun Wang*. HashGO: Hashing Gene Ontology for protein function prediction, Computational Biology and Chemistry, 2017, 71: 264-273.

15.  Jun Wang+, Long Zhang, Lianyin Jia, Yazhou Ren, Guoxian Yu*. Protein-Protein Interactions Prediction using a Novel Local Conjoint Triad De of Amino Acids Sequence, International Journal of Molecular Sciences, 2017, 18(11), 2373.

16.  Guoxian Yu*, Chang Lu+, Jun Wang. NoGOA: predicting noisy GO annotations using evidences and sparse representation, BMC Bioinformatics, 2017, 18: 350. CCF C

17.  Qiaoyu Tan+, Yanming Yu+, Guoxian Yu, Jun Wang*. Semi-supervised multi-label classification using incomplete label information, Neurocomputing, 2017, 260: 192-202. CCF C

18.  Jun Wang, Guangjun Yao+, Guoxian Yu*. Semi-supervised classification by discriminative regularization, Applied Soft Computing, 2017, 58: 245-255.

19.  Guoxian Yu*, Guangyuan Fu+, Chang Lu+, Yazhou Ren, Jun Wang*. BRWLDA: Bi-random walks for predicting lncRNA-disease associations, Oncotarget, 2017, 8(36): 60429-60446.

20.  Jie Liu+, Guoxian Yu, Yuan Jiang+, Jun Wang*. HiSeeker: Detecting High-Order SNP Interactions Based on Pairwise SNP Combinations, Genes, 2017, 8(6): 153.

21.  Guoxian Yu+, Xianxue Yu, Jun Wang*. Network-aided Bi-Clustering for discovering cancer subtypes, Scientific Reports, 2017, 7: 1046.

22.  Xianxue Yu+, Guoxian Yu, Jun Wang*. Clustering cancer gene expression data by projective clustering ensemble, PLoS ONE, 2017, 12(2): e0171429.

23.  傅广垣+,余国先*,王峻,郭茂祖. 基于正负样例的蛋白质功能预测, 计算机研究与发展, 2016, 53(8): 1753-1765.

24.  傅广垣+,余国先*,王峻,张自力. 基于有向混合图的蛋白质新功能预测, 中国科学-信息科学, 2016, 46(4): 461-475.

25.  Guangyuan Fu+, Jun Wang, Bo Yang, Guoxian Yu*. NegGOA: Negative GO Annotations Selection using Ontology Structure, Bioinformatics, 2016, 32(19): 2996-3004. CCF B

26.  Guoxian Yu*, Guangyuan Fu+, Jun Wang, Hailong Zhu. Predicting Protein Function via Semantic Integration of Multiple Networks, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB), 2016, 13(2): 220-232. CCF C

27.  Guoxian Yu*, Wei Luo, Guangyuan Fu, Jun Wang. Interspecies gene function prediction using semantic similarity, BMC Systems Biology, 2016, 10: 361.

28.  Jie Liu+, Jun Wang*, Guoxian Yu. Protein Function Prediction by Random Walks on a Hybrid Graph, Current Proteomics, 2016, 13(2): 130-142.

29.  Xuan Hou+, Guangjun Yao, Jun Wang*. Semi-Supervised Classification based on Low Rank Representation, Algorithms, 2016, 9(3): 48.

30.  Guoxian Yu+, Lei Feng, Guangjun Yao, Jun Wang*. Semi-supervised classification using multiple clusterings, Pattern Recognition and Image Analysis, 2016, 26(4): 681-687.

31.  Jun Wang, Le Zhang, Quan Zou, Jun Tan, Xiaowei Chen, Yukun Wu. Association studies on mtDNA and Parkinsons disease population discrimination using the statistical classification, Current Bioinformatics, 2014, 9:481-489.

32.  Jun Wang, Le Zhang, Chengyang Jing, Gang Ye, Hulin Wu, Hongyu Miao, Yukun Wu, Xiaobo Zhou. Multi-scale Agent-based Modeling on melanoma and its related angiogenesis analysis, Theoretical Biology and Medical Modelling, 2013, 10: 41.

33.  邹权,郭茂祖*,刘扬,王峻. 类别不平衡的分类方法及在生物信息学中的应用, 计算机研究与发展, 2010, 47(8): 1407-1414.

34.  王峻, 郭茂祖, 邹权, 基于线粒体SNP的疾病人群分类方法研究, 2009中国计算机大会, 2009, 739-746.

35.  Jun Wang, Maozu Guo, Chunyu Wang. CGTS: A Site-clustering Graph Based TagSNP Selection Algorithm in Genotype Data, BMC Bioinformatics, 2009, 10(1): S71. CCF C

36.  MaoZu Guo, Jun Wang*, Chunyu Wang, Yang Liu. A Hybrid Clustering and Graph Based Algorithm for TagSNP Selection, Soft Computing, 2009, 13(12):1143-1151.


获奖情况

青年教师成才奖(提名奖),2013

黑龙江省科技进步二等奖,2009

备注
欢迎对机器学习,数据挖掘,生物信息学感兴趣的研究生(+本科生)加入我们的研究队伍。我们为同学们提供发表高水平科研与应用成果的实验平台和良好宽松的学术氛围,为同学们提供获取各种国家和学校学院奖学金和创新项目、获取各种国内外相关竞赛奖项的机会,为同学们提供去往国内外知名高校(清华大学、哈尔滨工业大学、天津大学、香港中文大学、美国和欧洲多所合作大学)深造的机会,去往国内知名IT企业和研究所(阿里、腾讯、百度等)实习交流的机会,希望你的加入能够使得你和我们团队实现共同学习共同成长

欢迎访问我们团队主页: http://mlda.swu.edu.cn/ 了解更多团队情况。